⚜️ 1931 року отець Митрофан був заарештований Якимівським ГПУ, але за п’ять днів відпущений. Відповідно до характеристики, складеної для органів НКВС, Воздвиженський є «антирадянсько налаштований тип», «піп, соціально небезпечний для суспільства», який «у себе на квартирі систематично збирає контрреволюційний елемент», веде посилену агітацію проти колективізації та державної позики, «терористично висловлюється на адресу вождя т. Сталіна».

⚜️ 6 серпня 1937 року отець Митрофан був заарештований Якимівським районним відділком НКВС і ув’язнений до Якимівської в’язниці. На час арешту у нього були сорокатрирічна дружина Тетяна Онуфріївна і чотири дочки.

⚜️ Щодо священника було заведено кримінальну справу. Його звинувачували в «контрреволюційній агітації терористичного спрямування». На думку слідства, вона полягала в тому, що він під час перепису закликав людей підписуватися віруючими, поширюючи чутки, що невіруючим на лобі буде поставлено «печатку антихриста». Також отця Митрофана звинувачували, ніби він казав, що «в радянській владі сидять антихристи» і що «Сталіна вбити не гріх і весь ЦК».

⚜️ На єдиному допиті священник усі звинувачення відкинув, заявивши, що завжди говорить лише правду і жодною агітацією ніколи не займався.

⚜️ 10 жовтня 1937 року трійкою НКВС отець Митрофан був засуджений на десять років табору. У нелюдських умовах ГУЛАГу він не прожив і року. Смерть праведника настала 2 жовтня 1938 року.

⚜️ Постановою прокуратури Запорізької області від 27 вересня 1989 року отець Митрофан Воздвиженський був реабілітований.