Genomics UA

Запрошуємо на відкритий захист командних курсових проєктів курсу Геноміки ЮА "Вступ до аналізу протеомних даних"Учасники курсу обрали один з типів проєктів: біоінформатичний аналіз даних (🔸) або анотація метаданих (🔹), а також мову доповіді (українською 🇺🇦 чи англійською 🇬🇧).Під час зустрічі учасники курсу презентують мету аналізу наборів даних, хід аналізу, знахідки та їх інтерпретації. Наприкінці кожної презентації інструктори та відвідувачі зможуть ставити учасникам запитання.Теми курсових проєктів, представлених на захист, наступні (у порядку виступу):🔸Explainable Machine Learning for Cellular Phenotyping in Imaging Mass Cytometry (🇺🇦) [R8]🔸Re-analysis and computational validation of proteasome-generated spliced peptides in the HLA-I immunopeptidome (based on Liepe et al. 2016) (🇬🇧) [R4]🔸Proteomic analysis of macrophage polarization (🇺🇦) [R3]🔸Machine Learning Pipeline for Imaging Mass Cytometry Data Processing and Automated Single-Cell Annotation in Spatial Proteomics (🇬🇧) [R7]🔸Comparative Proteomics of Human Biofluids: Tears, Cerebrospinal Fluid and Plasma (🇺🇦) [R1]🔸Comparative proteomics of the frontal cortex in patients with Alzheimer's and Parkinson's (🇺🇦) [R6]🔸Proteasome-spliced peptides: abundance and MHC interaction analysis (🇬🇧) [R5]🔸Proteomic analysis of therapy resistance and clinical outcomes in acute myeloid leukemia (🇺🇦) [R2]🔹Metadata annotation and standardisation of public proteomics datasets (🇺🇦) [M1]Коли: 20 червня о 19:00 (київський час)Де: Google Meet / YouTube🗳Подобаються наші ініціативи? Ми відчуємо вашу підтримку через пожертву в нашу скарбничку, кошти якої будуть перераховані до фонду "Повернись живим" від імені спільноти Геноміки по завершенню курсу.🫶Поповнити банку курсу: https://send.monobank.ua/jar/5rrePd1kWw- - -Нагадуємо, що наша спільнота переїхала на Google Workspace. Ось інструкція як отримати доступ.- - -

☢️ Від геномних наслідків Чорнобильської катастрофи до T2T досліджень статевих хромосом Great Apes 🦍Професорка Катерина Макова є спеціалісткою з еволюції геному, мутагенезу та неканонічних структур ДНК. Використовуючи сучасні обчислювальні методи та передові дані секвенування, її лабораторія досліджує біологію мітохондріальної і Y хромосоми, а також non-B структури ДНК.К. Макова була запрошеною лекторкою на The Ukrainian School in Evolutionary Biology 2025, і ми раді приймати її в Genomics UA з презентацією нового препринту.Це дослідження присвячене тому, як Y-хромосома ссавців зберігає гени, пов’язані з фертильністю, попри відсутність рекомбінації та схильність до деградації. Автори показують, як специфічні геномні структури та еволюційні механізми допомагають підтримувати цілісність генів і функціональність ключових білків. 🇬🇧 Мова лекції: англійська📅 Коли: 27 травня 18:00 EEST📍 Де: Google Meet / YouTube трансляціяℹ️ Заходьте за логіном genomics . org . ua. Ось інструкція як отримати доступ.

Оголошення - два в одному 😮Наші друзі з ГО «Bioinformatics for Ukraine» мають дві захопливі пропозиції, повз які неможливо пройти 🌠🔹 Хочете тісно співпрацювати з науковцями для посилення біоінформатичної спільноти?🔹 Або ж потребуєте менторства для побудови власного шляху в науці?💎 Bio4UA шукає ентузіастів у сферах дизайну, підтримки соціальних мереж та планування освітніх подій. Детальніше тут:https://forms.gle/CjQS8K4AFsBvcMjW7🆘 Перший геномний біобанк України потребує вашої допомоги.🔺 Через постійні відключення електроенергії зразки колекції «T1 diabetes» перебувають під загрозою псування. Тому необхідно якнайшвидше придбати потужну батарею для підтримки роботи холодильників.🔺 Ця безцінна колекція має величезний потенціал для розвитку біоінформатичної екосистеми в Україні. У вас теж засвербіли руки проаналізувати ці дані?Навіщо і як допомогти біобанку - детальніше в дописі засновника Тараса Олексика.- - -Нагадуємо, що наша спільнота переїхала на Google Workspace. Ось інструкція як отримати доступ.- - -📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ bsky.social | 🔗 LinkedIn

Запрошуємо на відкритий захист командних курсових проєктів курсу Геноміки ЮА з біології поодиноких клітин та просторової біології!Під час зустрічі учасники курсу презентують мету аналізу наборів даних, хід аналізу, знахідки та їх інтерпретації. Наприкінці кожної презентації інструктори та відвідувачі зможуть ставити учасникам запитання.Теми курсових проєктів, представлених на захист, наступні:К1 ("Арррр") - Spatially resolved cell types and signatures in INPP5D-deficient Alzheimer’s miceК2 - Просторова транскриптоміка в контексті біомедичних досліджень: методи stemness, Xenium, Merfish та VisiumК3 - Функціональна гетерогенність фібробластів у шкірі людини: одноклітинний транскриптомний аналіз та вікові зміниК4 - Differential gene expression in single cells between preclinical and clinical stages of Alzheimer's disease.К5 - Аналіз даних секвенування РНК поодиноких клітин гліобластоми людиниК6 - Single-Cell Transcriptomic Analysis of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells in Acute Myeloid Leukemia and Chemotherapy ResponseК7 - Дослідження змін, спричинених опроміненнямК8 - Просторовий аналіз клітин у багатоканальних зображеннях: сегментація та оцінка експресії маркерівК9 - Вплив перебування в космосі на клітини мозку: аналіз за допомогою просторової транскриптомікиРозклад: в коментарі до цієї новини.Коли: 2025-04-23 та 2025-04-27, початок о 19:00 (київський час)Посилання: 2025-04-23 (https://youtube.com/live/tgIMlGe7_3k) та 2025-04-27 (https://youtube.com/live/J1BRSe4vrN0)- - -Нагадуємо, що наша спільнота переїхала на Google Workspace, де відбуваються ключові анонси й спілкування. Ось інструкція як отримати доступ.- - -📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ bsky.social | 🔗 LinkedIn

✨ Геноміка ЮА запрошує на літню школу Computational Research Advances in Biomedical Sciences (CRABS)!ℹ️ Цю школу організують наші друзі з Київської школи економіки та ГО "ГМО". Учасники школи візьмуть участь в біоінформатичних воркшопах та відвідають лекції від представників факультету, куди запрошені дослідники з різних університетів ЄС та США. Після загальної програми, учасники зможуть обрати спеціалізований трек й розвивати свої навички в одному з напрямів: (1) Omics data analysis; (2) Structural bioinformatics & drug development; (3) Bioinformatics for disease research and diagnostics. Слідкуйте за новинами на сайті, оскільки далі будуть анонсовані нові треки. Окрім навичок, учасники, які успішно виконають програму школи, отримають сертифікат з 3 ECTS від КШЕ.🤝 Сподіваємося побачити багато учасників спільноти Геноміки ЮА на заході!Коли: 10-17 серпня 2025Де: Київ, оффлайнДеталі та реєстрація: https://crabs.kse.ua до 2025-04-15- - -Дисклеймер: ми публікуємо цю можливість на безоплатній основі як інформаційні партнери заходу.- - -Нагадуємо, що наша спільнота переїхала на Google Workspace, де відбуваються ключові анонси й спілкування. Ось інструкція як отримати доступ.- - -📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ bsky.social | 🔗 LinkedIn

Лекція: огляд просторових та мультиплексних технологій та їх застосування в трансляційній онкології▶️ В біомедичних дослідженнях все більший попит мають методи просторової біології: коли для відкриття патобіологічних механізмів, біомаркерів та молекулярних цілей важливо не лише які біологічні процеси залучені, а ще й де це відбувається. Ми запросили Марію Яновицьку, лікарку-патолога, Principal Scientist з Boehringer Ingelheim, розповісти нам свій погляд щодо просторових та мультиплексних технологій та їх ролі в трансляційній онкології.▶️ Ця відкрита лекція є частиною курсу Геноміки ЮА з біології поодиноких клітин та просторової біології, під час якої учасники дізнаються більше про дослідження мікрооточень та сучасні просторові технології.Коли: 2025-04-02, 19:00 (час за Києвом).Інструкції для участі: https://genomics.org.ua/2025/03/06/lekcziya-oglyad-prostorovih-ta-multipleksnih-tehnologij-ta-їh-zastosuvannya-v-translyaczijnij-onkologiї/- - -Нагадуємо, що наша спільнота переїхала на Google Workspace, де відбуваються ключові анонси й спілкування. Ось інструкція як отримати доступ.- - -📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ bsky.social | 🔗 LinkedIn

До нас звернулися INNOV8, щоб розповісти про їх проєкт аудиторії Геноміки ЮА. Вони та їх партнери запрошують українських вчених (та тих, хто працює з наукомісткими проєктами) стати учасниками Science2Business. Ця програма належить до ініціативи ЄС Seeds of Bravery й націлена на допомогу з реалізацією інноваційних ідей як бізнесів. Серед напрямків програми, особливо релевантних для нашої спільноти, є біотехнології, охорона здоров’я, хімія, технології подвійного призначення.Учасники програми візьмуть участь в тренінгових заходах, а також отримають тематичне менторство. Організатори підкреслюють, що випускники програми зможуть податися на фінансування Seeds of Bravery.Зареєструватися на програму можна до 14 лютого 2025 року, 18:00.Деталі, реєстрація, та оголошення тут: https://innovate.com.ua/science2business/- - -Дисклеймер: ми не афілійовані з організаторами й публікуємо цю можливість на безоплатній основі. - - -Нагадуємо, що наша спільнота переїхала на Google Workspace, де відбуваються ключові анонси й спілкування. Ось інструкція як отримати доступ.- - -📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ bsky.social | 🔗 LinkedIn

🧬 Вітаємо спільноту Геноміки ЮА! 🎓 На початку 2025 року наша команда проведе новий освітній курс. Цей курс є частиною великої програми LifeSciencesCourse, яку профінансували DAAD, і яку координують наші колеги з кафедри біохімії та біотехнології ПНУ та Universität Tübingen. 🧑‍🎓 Курс орієнтований на студентів та аспірантів, хоча участь з інших кар'єрних рівнів не обмежується. Курс складається з двох модулів: перший для тих, хто хотів би опанувати R для аналізу біологічних (і не тільки) даних; другий по біоінформатичному аналізу даних секвенування РНК поодиноких клітин та просторової біології.✅ Завдяки фінансуванню DAAD, 18 студентів або аспірантів, які постраждали в наслідок війни й успішно пройдуть курс, можуть отримати стипендії по €400.Детальніше на нашому сайті: https://genomics.org.ua/2024/12/24/2025-daad-scrnaseq-spatial/Сторінка курсу на сайті LifeSciencesCourse (реєстрація, програма): http://lifesciencescourse.org/vstup-do-r-ta-rnk-sekvenuvannya. Також закликаємо передивитися їх інші курси 2025-го року.Реєстрація: на сайті LifeSciencesCourse до 2025-01-10.Ми запрошуємо усіх охочих реєструватися на курс й бажаємо успішного кар'єрного розвитку у 2025-му році. Будемо вдячні за розповсюдження!- - -Нагадуємо, що наша спільнота переїхала на Google Workspace, де відбуваються ключові анонси й спілкування. Ось інструкція як отримати доступ.- - -📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ bsky.social | 🔗 LinkedIn